北京基因组所高性能计算扩容项目
来源: | 作者:吴昊 | 发布时间: 2022-05-30 | 109 次浏览 | 分享到:
本项目旨在满足北京基因组所前沿科研需求,用于生命科学领域前沿新兴学科的计算模拟需求。满足实验与研究中心的组学数据(全基因组、外显子、RNA、蛋白质组数据)的存储、处理和运算的需求(约1万人/年)。

项目背景:中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center, BIGD)于2016年2月29日正式成立。生命与健康大数据中心,稳居中科院生命领域计算排名之首,已达到1.6Gbps网络带宽,总计算能力100万亿次/秒。为中科院内外16家生命科研单位,共74个课题组的提供基本数据储存与共享服务,平均每天活跃用户超过500位,每天完成计算任务多达3000余个。

 

需求分析:本项目旨在满足北京基因组所前沿科研需求,用于生命科学领域前沿新兴学科的计算模拟需求。满足实验与研究中心的组学数据(全基因组、外显子、RNA、蛋白质组数据)的存储、处理和运算的需求(约1万人/年)。

构建高性能运算集群所需的服务器、存储、网络连接、信息安全等硬件设备。

提供高性能运算集群所需的集群管理、作业调度等软件,以及软件的安装调试。

 

计算系统

包括30台曙光TC4600E刀片(Intel Xeon E5-2650v4 2.2G 35M 12C*2;16G DDR4 2133 ECC REG 内存*8)以及2台曙光I840-G20四路服务器,峰值性能为29286.4GFlops

管理登录系统:

包括4台曙光I620-G20机架服务器(双路Intel Xeon E5-2620v3 2.4G,64GB mem),部署曙光Gridview集群管理系统,PBS作业调度系统。

存储系统:

包括1套ParaStor300云存储系统索引控制器2,数据控制器11台,总裸容量1584TB。1套曙光DS600-G20磁盘阵列,总裸容量384TB。

网络系统

包括2台36端口Infiniband FDR交换机(56Gb/s)。


##########
<big id='Pa'><tt></tt></big>
    <dir id='sAHukA'><dir></dir></dir>
        <font id='qZSuoCTv'><kbd></kbd></font><sub id='XFTtAv'><marquee></marquee></sub><strong id='tFYhLJEp'><sub></sub></strong><s id='GyDpYJEP'><tt></tt></s>
          <blockquote id='IAQQ'><marquee></marquee></blockquote><big id='xMevZZvl'><listing></listing></big><bgsound id='BIYXb'><font></font></bgsound>
          <u></u>
            <xmp id='fF'><xmp></xmp></xmp>